A reconstituição dos procedimentos pré-decolagem mostra que, às 17h10 do dia 29 (hora de Greenwich, 14h10 pelo horário de Brasília), o Cindacta-1 "alocou o código transponder 4574 para o Aeroporto Eduardo Gomes (em Manaus) e autorizou o vôo pela aerovia UW 2 (de mão única, cujo destino é Brasília) a 37 mil pés de altitude".
Dois minutos depois, a torre de controle de São José dos Campos, de onde o Legacy partiu, voltou a se comunicar com o piloto. Por rádio, o controlador de vôo forneceu a Lepore o código 0140, que deveria ser usado do momento da decolagem até Brasília, onde ele teria de mudar de altitude e de aerovia.
Segundo oficiais da Aeronáutica, mesmo que o novo código não tenha sido digitado, o transponder continuaria funcionando. "Esse aparelho não é como um rádio, que captada as ondas enviadas por uma antena em terra. É ele que emite os sinais para os radares. Por isso, não importa onde o avião esteja", esclarece um militar. A mudança do código, diz ele, serve principalmente para indicar a qual centro de controle a aeronave está subordinada.
Desde o início das investigações, os pilotos do Legacy têm negado o desligamento proposital do transponder. A Aeronáutica, no entanto, afirma que o equipamento deixou de funcionar 15 minutos antes da colisão com o Boeing da Gol, voltando ao normal em seguida. "É possível que o transponder estivesse em 'stand by' sem que o piloto tivesse percebido e que, após o choque, ele tenha se dado conta disso, já que digitou o código de emergência do aparelho", comenta um militar.
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